研究員 伊東 真吾
学歴
2011年 | 名古屋大学 理学部 物理学科 卒業 |
2013年 | 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻(物理系)修士課程 終了 |
2016年 | 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻(物理系)博士課程 終了 |
研究歴
2016年 | 名古屋大学 大学院理学研究科 博士研究員 |
2018年 | ボストン大学 化学科 博士研究員 |
2019年 | 理化学研究所 杉田理論分子科学研究室 特別研究員(現在に至る) |
所属学会
日本生物物理学会研究テーマ
- 分子動力学法による酵素反応機構の解明
- 自由エネルギー計算手法の開発
- 分子動力学パッケージの改良および開発
原著論文
- Water-mediated deracemization of a bisporphyrin helicate assisted by diastereoselective encapsulation of chiral guests. N. Ousaka, S. Yamamoto, H. Iida, T. Iwata, S. Ito, Y. Hijikata, S. Irle, and E. Yashima* Nat. Commum., 10, 1457 (2019).
- Quantum chemical replica-exchange umbrella sampling molecular dynamics simulations reveal the formation mechanism of iron phthalocyanine from iron and phthalonitrile. S. Ito, Y. Wang, Y. Okamoto*, S. Irle* J. Chem. Phys., 149, 072332 (2018).
- Implementation of replica-exchange umbrella sampling in GAMESS. S. Ito, D. G. Fedorov, Y. Okamoto*, S. Irle* Comput. Phys. Commum., 228, 152-162 (2018).
- Implementation of replica-exchange umbrella sampling in the DFTB+ semiempirical quantum chemistry package. S. Ito, S. Irle, Y. Okamoto* Comput. Phys. Commum., 204, 1-10 (2016).
- QM/MM free energy simulations: recent progress and challenges. X. Lu, D. Fang, S. Ito, Y. Okamoto, V. Ovchinnikov, Q. Cui* Mol. Sim., 42, 1056-1078 (2016).