メンバー構成員

特別研究員 田村 康一

学歴

2009.3 京都大学 理学部 卒業
2011.3 京都大学 理学研究科 博士課程前期課程 修了
2016.3 京都大学 理学研究科 博士課程後期課程 修了 (博士(理学))

研究歴

2014.4-2016.3 日本学術振興会特別研究員DC2 (京都大学)
2016.4-2018.3 理化学研究所 計算科学研究機構 特別研究員
2018.4- 理化学研究所 計算科学研究センター 基礎科学特別研究員

所属学会

日本生物物理学会

研究テーマ

分子シミュレーションによる ABC トランスポーターの構造機能解析

出版物

  1. Chemo-Mechanical Coupling in the Transport Cycle of a Heme ABC Transporter.
    Koichi Tamura, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro, and Yuji Sugita
  2. GENESIS 1.1: A hybrid-parallel molecular dynamics simulator with enhanced sampling algorithms on multiple computational platforms.
    Chigusa Kobayashi, Jaewoon Jung, Yasuhiro Matsunaga, Takaharu Mori, Tadashi Ando, Koichi Tamura, Motoshi Kamiya, and Yuji Sugita
  3. Atomistic Modeling of Alternating Access of a Mitochondrial ADP/ATP Membrane Transporter with Molecular Simulations.
    Koichi Tamura and Shigehiko Hayashi
  4. Role of Bulk Water Environment in Regulation of Functional Hydrogen-Bond Network in Photoactive Yellow Protein.
    Koichi Tamura and Shigehiko Hayashi
  5. Linear Response Path Following: A Molecular Dynamics Method To Simulate Global Conformational Changes of Protein upon Ligand Binding.
    Koichi Tamura and Shigehiko Hayashi